નલિયાકાંડમાં તટસ્થ અને નિષ્પક્ષ તપાસ થાય તે માટે તેનું મોનિટરીંગ CID ક્રાઈમને સોંપાઈ છે. હાલમાં આ કેસની તપાસ માટે સ્પેશિયલ ઈન્વેસ્ટીંગેશન ટીમ રચવામાં આવી છે. જોકે, હવે આ ટીમે નિયમિત ધોરણે તપાસ અંગેનો અહેવાલ CID ક્રાઈમને સોંપવાનો રહેશે. ઉલ્લેખનીય છે કે વિપક્ષ દ્વારા આ કેસમાં સરકાર ભીનું સંકેલી રહી હોવાનો સતત આક્ષેપ કરતી રહી છે.